Σύνοψη

Το EGFR είναι ο πιο συχνά ελεγχόμενος ενεργητικός παράγοντας στον μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα, ωστόσο μια μόνο δοκιμή σπάνια λέει όλη την ιστορία.Το πίνακα ανίχνευσης του EGFR σε 5 σημεία DdPCR ανακρίνει πέντε κλινικά σημαντικά σημεία G719S, T790M, L858R, L861Q, και διαγραφή εξόντων 19 χρησιμοποιώντας ψηφιακή σταγονιδιακή PCR, μια τεχνική που έχει κατασκευαστεί για να βρει μεταλλάξεις πολύ χαμηλής αφθονίας που η συμβατική αλληλουχία μπορεί να χάσει.Αυτό το άρθρο εξηγεί τη βιολογία πίσω από κάθε τοποθεσία, γιατί το T790M έχει σημασία μετά την θεραπεία TKI πρώτης γραμμής και πώς η ψηφιακή ευαισθησία PCR αναδιαμορφώνει την παρακολούθηση της αντοχής.

Πρωταρχικές μεταλλάξεις ενεργοποίησης: L858R και διαγραφή του εξόνου 19

Η L858R στο εξόν 21 και η διαγραφή του εξόν 19 είναι οι δύο πιο κοινές μεταλλάξεις ενεργοποίησης του EGFR, που αντιπροσωπεύουν τις περισσότερες ευαίσθητες στην TKI ασθένειες.Η DdPCR παρέχει ταχεία επιβεβαίωση για τους ασθενείς που πρόκειται να ξεκινήσουν θεραπεία πρώτης γραμμήςΗ ανίχνευση στο κυκλοφορούν DNA του όγκου επιτρέπει επίσης την παρακολούθηση της ανταπόκρισης στη θεραπεία: η μείωση του κλάσματος των μεταλλαγμένων αλληλών υποδηλώνει έλεγχο της νόσου,Ενώ ένα αυξανόμενο μπορεί να προειδοποιήσει για πρόοδο πριν από την απεικόνιση..

T790M και αντίσταση TKI πρώτης γραμμής

Η T790M είναι ο κλασικός μηχανισμός απόκτητης αντοχής σε EGFR TKI πρώτης και δεύτερης γενιάς.και η παρουσία του αλλάζει τη διαχείρισηΟι αναστολείς τρίτης γενιάς είναι το επόμενο στάδιο, επειδή δρουν σε κλώνους που φέρουν T790M.Η πρόκληση είναι ότι ο κλώνος είναι συχνά παρόν σε χαμηλό κλάσμα στο κυκλοφορούν DNA του όγκου κατά την εξέλιξηΗ ψηφιακή PCR διαχωρίζει το DNA σε χιλιάδες σταγόνες και μετρά θετικά γεγονότα, ανιχνεύοντας αντίγραφα κάτω από την ανάλυση των συνήθων μεθόδων.

Γιατί το G719S και το L861Q αξίζουν τα δικά τους πρωτότυπα

Οι G719S (εξόνιο 18) και L861Q (εξόνιο 21) είναι λιγότερο συχνές παραλλαγές του EGFR, αλλά δεν είναι βιολογικά άσχετες.και ορισμένες κατευθυντήριες γραμμές τις ομαδοποιούν σε κατηγορίες σχετικές με τη θεραπείαΗ συμπερίληψή τους σε μια πενταετή ομαδική οθόνη προβάλλει σπάνιες παραλλαγές που θα μπορούσαν διαφορετικά να παραλείψουν αν δοκιμαστούν μόνο τα κλασικά σημεία, διευρύνοντας την κλινική χρησιμότητα χωρίς να επεκταθεί σε πλήρη κλίμακα γονιδίων.

Υψηλή ευαισθησία σε αντίσταση χαμηλής συχνότητας

Το ισχυρότερο επιχείρημα για την DdPCR στην παρακολούθηση της αντοχής είναι η αναλυτική ευαισθησία.και ένα κλώνο αντίστασης μπορεί να συμβάλει μόνο ένα μικρό μέρος του συνόλουΗ ψηφιακή σταγόνα PCR αντέχει αυτό το υπόβαθρο πολύ καλύτερα από τις ομαλές μεθόδους, επειδή κάθε σταγόνα είναι μια ανεξάρτητη αντίδραση, έτσι ώστε τα σπάνια μεταλλαγμένα γεγονότα να μετρούνται αντί να απομακρύνονται κατά μέσο όρο.Η ανταμοιβή είναι η έγκαιρη ανίχνευση της αναδυόμενης αντίστασης..

Γενικές ερωτήσεις

Ε: Γιατί το T790M είναι η πιο σημαντική τοποθεσία σε αυτό το πάνελ;Α: Το T790M είναι ο πιο κοινός μηχανισμός απόκτητης αντοχής σε EGFR TKI πρώτης και δεύτερης γενιάς.Η ανίχνευσή του σε χαμηλή αφθονία υποστηρίζει τη μετάβαση σε έναν αναστολέα τρίτης γενιάς ενεργό κατά των όγκων που φέρουν T790M..

Ε: Πώς η DdPCR ανιχνεύει μεταλλάξεις που η αλληλουχία μπορεί να χάσει;Α: Η DdPCR χωρίζει το δείγμα σε χιλιάδες σταγόνες και μετρά τις θετικές αντιδράσεις ξεχωριστά, ποσοτικοποιώντας τα χαμηλά μεταλλαγμένα κλάσματα που είναι θαμμένα στο βάθος του άγριου τύπου αίματος.

Ε: Θεωρούνται οι G719S και L861Q οι ίδιες με τις L858R και 19del;Οι ασυνήθιστες παραλλαγές εξακολουθούν να ανταποκρίνονται σε ορισμένα ΤΚΙ, αλλά ομαδοποιούνται ξεχωριστά στις κατευθυντήριες γραμμές, έτσι ώστε να αποφεύγεται η απώλεια σπάνιων θεραπεύσιμων παραλλαγών.

Ε: Τι τύπο δείγματος χρησιμοποιεί αυτό το πάνελ DdPCR EGFR;Α: Εφαρμόζεται συνήθως στο πλάσμα ctDNA για μη επεμβατική παρακολούθηση, αν και μπορεί επίσης να διερωτηθεί το DNA ιστών.